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漕运如此重大的事宜，孤军奋战是不可能有什么成效的，必须要有官府和百姓的配合，此次漕运任务的顺利完成，得益于郑家军的强悍，可是这样的情形只是暂时的，郑家军不可能长时间从事漕运事宜，郑家军有自身的任务，不断发展强大才是其目前该做的事情。
早在动手之前，郑勋睿就有着深远的计划，第一步是严惩作恶多端的官吏，以及漕帮，在此基础上树立起来漕运总督府的威望，但也要维持地方官府的正常运转，应该说这一步的目的基本达到了，被郑勋睿训斥的近五百官吏回到地方之后，变得格外的老实，老老实实做事情，再也不敢打漕粮的主意，对于漕运总督府下达的文书以及告示，都是不折不扣的执行，这些官吏也维持了地方官府正常的运转，让各地慢慢平静下来。
第二步就是官吏必须配备到位了。
漕运总督府六房的司吏、典吏以及承差，几乎都更换了，文坤成为了正八品的知事，统管六房，当然在重大的事情方面，文坤还是要及时给郑勋睿禀报的，而且在︾，处理日常事物的时候，也是充分尊重徐望华的意见建议。
但这仅仅是开始，地方官吏的配备，以及卫漕兵丁的调整，同样要着手进行，毕竟漕运牵涉到方方面面，而且仅仅是官府的动作，也是不行的，既然打掉了漕帮，那就应该有相应的地方组织来协调漕运的相关事宜，毕竟官府的官吏对漕运不可能特别的熟悉。俗话说得好，隔行如隔山，大明的官吏，对商贾事宜都不是特别的熟悉，这是因为体制缘故造成的，短时间之内也不可能改变。如此的情况之下，就必须有民间组织出面来协调漕运的事宜。
这第二步是整治是否能够成功的关键。
所以郑勋睿的绝大部分精力，都放到这上面了，他的计划是很深远的。
漕运并非最为重要的事宜，说起来就是利用京杭大运河贯穿南北的物资交流，这个任务并不是很复杂，无非是掌管此事的官吏，以及民间的某些协调组织，产生了邪念。加之这里面有东林党人插手了，让漕运变得异常的复杂，也变得黑幕重重，一旦斩断了其中的利益链条，漕运就能够变得简单了。
郑勋睿的主要精力，还是在郑家军的建设方面。
此次端掉了十大漕帮，顺带也清除了一些名不见经传的小漕帮，郑家军缴获了三千万两白银。这些银子可以做大事情了，同时郑勋睿和郑家军都来到了南方。淮安靠近南京，郑勋睿计划的壮大郑家军实力、潜心研发火器的计划，可以开始考虑和实施了。
让郑家军成为一支无坚不摧的军队，这才是郑勋睿最为要紧的事情。
相关的奏折早就送到京城去了，不过皇上的圣旨和吏部的敕书迟迟没有下来，郑勋睿也不好催促。这期间他接到了杨廷枢的来信，杨廷枢仔细说了京城里面的波动，说到朝野对淮安发生的事情，还是有着很多议论的，但是皇上没有专门提及此事。早朝也没有议论这件事情，几个押解到京城的知府，关在大理寺的监牢里面，暂时也没有人理睬。
京城里面如此平静的局面，应该是在郑勋睿的预料之中的，他早就做过前期的准备事宜，写了好几封信，稳住了某些人的情绪，要不然出现这么大的事情，京城里面岂不是炸锅了。
圣旨和敕书迟迟不下来，郑勋睿想到了东林党人。
淮安的动作，应该是威胁到东林党人的根基了，且不说京城，就说南方，东林党人引以为豪的黄道周都亲自出面了，可见东林党人是察觉到了危险的，只不过没有地方着手。
当然郑勋睿有着绝对的信心，这一次的动作，迅雷不及掩耳，东林党人不可能做出很好的准备，也想不到其他的办法来应对，不仅仅是这样，一旦做好了第一步和第二步的所有事宜，接下来郑勋睿就要开始对准南方的那些士大夫和商贾了。
所以郑勋睿不着急，耐心等待皇上的圣旨或者是吏部的敕书。
十一月初一，吏部的敕书终于到了。
史可法出任巡漕参政，马士英出任督催参政，粟建成出任押运参政，三人的品阶皆为从三品。
梁兴力出任巡漕御史，赵单羽出任督催御史，两人的品阶皆为正七品。